ZEISS ZEN

透過光や位相差などの画像と蛍光チャンネルを必要に応じて組み合わせ、マルチチャンネル画像を作成します。その際、統合したデータベースから色素の選択が可能です。あらかじめ500種以上の蛍光色素データがセットされているため、必要に応じて拡張できます。

蛍光励起波長ごとに各チャンネルが最適な露出時間を取得し、顕微鏡の設定が各チャンネルに割り当てられます。撮影スケジュールはフレキシブルに、複雑なマルチチャンネル撮影は簡単に行えます。

電動フォーカスドライブを使用しながらZ軸方向のスタック画像を取得できます。
画像取得プログラムが高精度かつ適切な間隔で、鏡基のZ軸ドライブを制御して画像を同期します。また、間隔の計算は手動あるいは自動の設定が可能です。

その他、グラフィックサポートを得ながらZ-スタックを作成することができます。これは画像取得中でも利用が可能。画像データは .CZI ファイルにコンパクトに保存します。

過去に取得したZ-スタックから、拡張した被写体深度のある画像が構築できます。
異なるフォーカス面で撮影された複数の画像から鮮明な部分を抽出し、新しい1枚の画像に合成します。透過光、反射光、蛍光のいずれでも被写体深度を得ることが可能です。

オプションの ZEN タイリング、多点撮影モジュールと電動ステージは、試料を自動でスキャンして大きな領域を解析することができます。
複数の画像から１枚の大きな全体画像を構築することが可能なため、試料を俯瞰的に操作したり観察したい領域に容易にズームすることができます。タイリング、多点撮影および ZEN が隣接する画像同士を精密に並べ、より詳細に解析できるよう、最大限にその可能性を広げます。

マルチウェルプレート、マルチチャンバスライド、ディッシュ上で対話式にポジションをマーキング。 マウスを１回クリックするだけで、すぐにその位置を見つることができます。

マウスを数回クリックするだけで様々な次元の画像をつなぎ合わせ、複雑な画像を構築することができます。
画像取得タスクの組み合わせを計画したり、それを繰り返し利用できます。たとえば、時系列、Z-スタック、タイル/多点画像およびチャンネル等も、撮影ブロック の使用で明確に可視化することが可能になります。

ループの使用で繰り返しの作業が容易になり、撮影時間の延長や設定変更が必要になった場合でも、 ポーズまたは対話式より決定できます。また、実験における撮影ブロックの数にほとんど制限がないため、保存されたブロックはいつでも読み込みが可能です。

ZEISS顕微鏡、カメラ、イメージングソフトウェアをコントロールできます。
コンパクトな画像シーケンスの中に試料の動的プロセスを記録することが可能になり、1000分の1秒の精度で顕微鏡の露出設定を制御します。タイムラプスモジュールで長時間の露出により生じる試料への不要なダメージもなくなります。これは生きた試料の定量解析に欠かせない条件です。

画像はAVIやMOV等の一般的な動画フォーマットにいつでもエクスポート可能なため、デモおよび論文掲載用に利用できます。画像取得のスピードやサイズはハードドライブの空き容量のみに依存します。

顕微鏡の焦点深度からの制限を受けずに画像を構築することができます。
ソフトウェアモジュールが対話式に異なるフォーカスポジションで、取得したZ-スタックからシャープな細部を抽出。それらを最適な焦点深度でひとつの画像に編集します。また、ライブ画像表示を使用して追加画像を中間結果に追加することが可能です。

画像のどの領域でも常に最高の焦点深度を得ることができます。これは使用する検鏡法に影響されず、ウェーブレットアルゴリズムによって、透過光でも反射光でも蛍光でも可能です。

透過光、反射光、蛍光のいずれの試料でも 最適なフォーカス位置が決定できます。
ZENは毎日使用する光学顕微鏡から理想的なポジションを「学習」しています。フォーカス補正はもちろん、キャリブレーションの手順も不要です。自動的にフォーカスが記録されてすべての対物レンズと検鏡法に適用されます。

経時撮影、または複数の異なる位置から取得した画像の場合、システムは 自動的に継続してフォーカスを繰り返します。

試料が1視野に収まらない場合に、パノラマを使用して個々の画像から高解像度な全体画像を獲得します。
ソフトウェアがピクセル単位の精度で画像をつなぎ合わせ、互いにオフセットで取得した画像でもZENおよびパノラマの利用で、高精度で画像のつなぎ合わせが可能になります。顕微鏡からのぞいて撮影した試料の画像から、重要な細部がひとつの画像の中におさめられている、ということになります。

さらに「ジョイスティック」でライブ画像を使用し、より高速画像の取得が可能になります。

異なる蛍光チャンネルのオーバーラップした信号のアンミックスに使用できます。
ZEN ソフトウェアは、Costes.による自動閾値方法等、近代的手法を活用。タンパク質のコロカライゼーションについて、散布図、画像ならびにデータテーブルという形式で獲得できます。

画像のある特定領域の解析をするには、画像と散布図上の該当領域にマーキングするだけです。そのとき、ZEN用スペクトルコロカライゼーションが、全体画像と選択領域の双方のデータを提供します。もちろん、測定値をCSV フォーマットにエクスポートし、スプレッドシートを使用してその後の処理も可能です。

顕微鏡システムの持つ光学特性により、焦点面の上下のエリアからの光も画像に入り込みます。これは、試料の微細構造がそれ以上抽出できないことを表しています。

3Dデコンボルーションソフトウェアモジュールは、イメージスタック中の逆光を計算することにより、元の位置に戻します。歪んだ試料構造が元へ戻り、よりシャープな画像が表示されます。それまで存在していた画像ノイズも軽減し、スタック画像や3次元モデルをより高画質にすることができます。

多次元画像スタックを3Dボリュームモデルとして表示できます。
ZENモジュールは8チャンネルまで処理可能。さらに空間画像座標も画像に関するタイムラプス情報を考慮します。

どの表示方法でも3Dモデルを対話式に配置し、注釈、座標軸、スケール軸を表示できます。3Dxl は距離と角度を対話式で測定するパワフルなツールです。プレゼンテーションや投稿に使用する場合は、TIF、JPG、AVI 等、一般的に使用されているフォーマットに、画像やアニメーションをただエクスポートするだけです。

プログラミングの知識がなくても自動測定が設定できます。
測定プログラムウィザードを使用すれば、わずか数分のうちに複雑な測定作業が完了。一度作成すれば、膨大な量の画像にもプログラムをいつでも利用でき、常に測定プロセス全体をコントロールできる状態を維持します。

設定、手順については対話式で変更が可能。自動で実行するプロセスを簡単に遮断、条件に合わせた設定へ調整できます。また、必要に応じてImage Analysisモジュールを使用し、ExcelのCSVフォーマットに測定データを エクスポート して、自由に加工が可能です。

対話式で微細構造を測定し、細胞小器官の濃淡値プロファイルを生成します。細胞核の輪郭をマウスで指定して面積を決定。細胞数のカウントはその上をクリックするだけです。

ZENおよび手動計測モジュールでは、90種以上の形態パラメータのうち、どれを使用し画像中で測定するかを決定します。たとえばContourツールでは、細胞の面積、直径、周囲長を同時に決定。細胞の包括的で高精度の解析が一回の操作で、しかもオンライン上の画像でも実行し、各ツールにもどの測定結果を画像に表示するのか設定できます。

手動計測モジュールでは、表でもリストでもグラフでも測定データを表示できます。ZEN2011は測定結果を画像データとともに新しいCZIファイルフォーマットに保存します。ExcelのCSVフォーマットにいつでも測定データをエクスポートできるため、ドキュメンテーションや解析に利用が可能です。

OADは定評のあるPython言語に基づいた独自のマクロソリューションです。ZENの主要な機能へ簡単にアクセスして.Net Framework 等、ライブラリを取り込むことも可能です。

OADコミュニティでは、ZEN OAD Forumでのマクロのディスカッションや、ソリューションサポートに参加いただけます。